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我是高中生侦探工藤新一。人称平成年代的福尔摩斯和日本警察的救世主。这一切的故事都要从小兰，也就是我的青梅竹马，获得空手道优胜的一天前说起。当时我答应过她只要她获得优胜就带他去热带乐园玩。也就是因为个承诺，让小兰充满了信心。也正因为如此所以她在比赛上的成绩非常优异。这也可以说是这整件事情的导火线。如果没有这次比赛的话，后面的一切也有可能就不会发生。可是世间的一切并不可能如此如愿。最终我们还是去了热带乐园。刚去热带乐园玩，就发生了不好的事情。我们在玩云霄飞车的时候发生了杀人事件。不过我瞬间就用我
敏锐的观察力，加上高超的思维能力，再加上精彩的推理瞬间就把这个案子给破解了。不过与此同时，我在云霄飞车上也遇见了两个穿着黑色衣服，不太像好人的人。在准备回家的时候我又在嗯热，太热园里发现了那个可疑男子的行踪，我让小兰先回去后就去跟踪那个黑衣人。
我跟踪上去之后我发现那个黑人在和某个公司的社长做可疑的交易。当时我只注意着交易却忽略了从背后而来的另一个同伙，他把我打晕以后给我灌了药。当我再次醒来的时候我的身体已经缩小了。当时我没有办法只能找我最信任的阿笠博士，不过如果让他们知道我的真实身份以后可能连小兰，甚至我周遭的一些人都有可能会有危险。在阿笠博士的建议下，我隐瞒了身份。当小兰问起我的名字时，情急之下我化名为江户川柯南。因为小兰的父亲是侦探，所以我就记住在小兰家中，因为我确信如果其实在小兰的家中可能会有他们黑衣组织的线索。我本以为小兰的父亲毛利小五郎，是个比较好的侦探谁知道，毛利叔叔却是一个糊涂大侦探。当我看不下去的时候我就用阿笠博士给我的手表行吗？最抢江苏宿舍晕，以后利用，阿笠博士给我的蝴蝶结蝴蝶结变身器装做叔叔的声音解决案子。毛利叔叔也拜我之赐成为名气众多的大侦探——名侦探毛利小五郎，人称沉睡的小五郎。至于原因吗？我刚才也说过了。也因为我说小了，所以小兰才让我去帝丹小学上学。在一年级a班中认识了元太、步美、光彦三人。也正因如此，被迫和他们组成了少年侦探团。
在这里我说下知道我真实身份的人。第一个人就是阿笠博士因为他是我最信任的人，所以最先知道身份的人是他。第二个服部平次，他则是从言行举止中观察出来的我的真实身份也正因为如此，成为了我出生入死的伙伴。第三个人灰原哀本名宫野志保，她以前是黑暗组织的人，但因为她的姐姐宫野明美被杀害以后从此背叛了组织。第五个人，我的父母。我的父亲是一个人人皆知的推理小说家提到，暗夜男爵系列可算是无人不知无人不晓得。我母亲那是一个以20岁就退出了娱乐界的名演员。不过和工藤优作结婚了，不过现在只是个啰嗦的老巫婆而已。而我的父母呢，又经常在美国，不经常回日本，所以他每次他们每次出现的时候都特别喜爱开玩笑，虽然已经是年过，反正很老的人啦，但就是忍不住开玩笑。
另外还有四个人知道我的身份。李神天、陈星、杜冯祥、王宇航。他们的真实身份是……还有人也在调查黑暗组织！赤井秀一和朱蒂·圣提米利翁还有詹姆斯·布拉克都是fbi的人。不过，在一次任务中赤井秀一意外身亡了！冲失昂是一个借住在我家的研究生，和我一样也是一个夏洛克福尔摩斯的热迷。不过，他的真实身份是……还有一个人，虽然她不知道我的真实身份，但是对我来说可能也是潜在的威胁——世良真纯。不过她的身份到令我很惊讶，因为她居然是赤井秀一的妹妹。水无玲奈：是我们在组织安放的卧底，cia的成员。在组织的代号是基尔。本堂瑛祐是水无玲奈的弟弟。安室透，同样是cia的人，潜伏在组织内的卧底。代号波本。
虽然身体变小，但头脑一样棒！还是能做一个无所不知的名侦探。看透一切的真相！
真相永远只有一个！